Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Otx2P80206 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms