Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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