Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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