Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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SrprbP47758 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms