Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cdkn1bP46414 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms