Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms