Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou4f1P17208 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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