Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Cldn10-201ENSMUST00000047761 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxb4P10284 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms