Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm2035J3QP87 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm2035J3QP87 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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