Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm34424-202ENSMUST00000214104 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 C6-203ENSMUST00000162350 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Stam2-201ENSMUST00000102759 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ccdc86-201ENSMUST00000025639 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Trappc9-201ENSMUST00000023276 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Tnfrsf1b-201ENSMUST00000030336 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Snx25-207ENSMUST00000170416 3067 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Clec7a-201ENSMUST00000112076 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Smim18J3QNP2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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