Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms