Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6F6VAN0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms