Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf169E9Q7F2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf169E9Q7F2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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