Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12408-206ENSMUST00000211577 1983 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Olfml2b-201ENSMUST00000046792 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gtf3c6Q9D8P7 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c6Q9D8P7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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