Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms