Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg3Q9CPX6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg3Q9CPX6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms