Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Bhlhe41Q99PV5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Bhlhe41Q99PV5 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.2 ms