Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pacsin3Q99JB8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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