Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms