Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cwc22Q8C5N3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms