Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Atg16l1Q8C0J2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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