Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Zfp398Q8BV16 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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