Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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