Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ubash3bQ8BGG7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubash3bQ8BGG7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms