Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp49Q6P9L4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp49Q6P9L4 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms