Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Bhlha9Q5RJB0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms