Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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