Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms