Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm11888-201ENSMUST00000120471 810 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Olfr122-201ENSMUST00000119082 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms