Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Top1Q04750 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Top1Q04750 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms