Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GscQ02591 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
GscQ02591 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
GscQ02591 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms