Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Grin2cQ01098 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms