Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gbx1P82976 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gbx1P82976 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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