Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atp5bP56480 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms