Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CtskP55097 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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CtskP55097 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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CtskP55097 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtskP55097 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtskP55097 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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