Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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VdrP48281 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VdrP48281 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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