Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rpl28P41105 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms