Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp4P35123 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp4P35123 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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