Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kif5cP28738 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kif5cP28738 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms