Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Csnk2a2O54833 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms