Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms