Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ssxb8B1AY40 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ssxb8B1AY40 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ssxb8B1AY40 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ssxb8B1AY40 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssxb8B1AY40 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssxb8B1AY40 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssxb8B1AY40 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ssxb8B1AY40 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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