Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Higd1aQ9JLR9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms