Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm14735-201ENSMUST00000121772 3088 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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