Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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