Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Rab6a-203ENSMUST00000107048 2617 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4924-201ENSMUST00000165906 2645 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6Q9D8P7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gtf3c6Q9D8P7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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