Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Cldn22Q9D7U6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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