Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms