Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp16Q99LG0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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