Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lrrc9Q8CDN9 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lrrc9Q8CDN9 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Lrrc9Q8CDN9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc9Q8CDN9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms